เมื่อได้มีการก่อสร้างมัสยิดมหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์แล้วเสร็จ นายกสภามหาวิทยาลัย (ผศ.ดร.จงรัก พลาศัย) ได้มีดำริให้ก่อสร้างศูนย์ตาดีกาประจำมัสยิดมหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์ขึ้นเฉกเช่น มัสยิดต่างๆ ในพื้นที่ และประสงค์ที่จะให้เป็นศูนย์สาธิตการศึกษาอิสลามที่มีคุณภาพเพื่อเป็นตัวอย่างให้กับศูนย์ตาดีกาต่าง ๆ ในจังหวัดนราธิวาสและพื้นที่จังหวัดใกล้เคียง เพื่อยกระดับการศึกษาและวิชาการให้กับศูนย์ตาดีกาต่างๆ อย่างเป็นระบบ และถือเป็นพันธกิจหนึ่งของ สถาบันอิสลามและอาหรับศึกษา มหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์